يعتبر متحف المدينة المنورة بمحطة سكة حديد الحجاز أحد أبرز المتاحف الذي نفذت الهيئة العامة للسياحة والآثار مرحلته الأولى في محطة سكة الحديد، والذي جعل منه واجهة حضارية للمنطقة التي تتميز بوفرة المواقع الأثرية ومواقع التاريخ الإسلامي فيها.
الجدير بالذكر أن المبنى التاريخي تم تدشينه بوصول أول قطار من دمشق إلى المدينة المنورة يوم 22 رجب 1326 هـ الموافق 28 آب/أغسطس 1908 م ، وفي عام 1419 هـ تم تحويله لمتحف باستخدام قاعات المتحف لعروض أثرية وتاريخية ، فيما يستخدم حرمها لإقامة بعض المهرجانات الثقافية .
ويشمل المتحف مباني محطة سكة حديد الحجاز في المدينة المنورة التي تم ترميمها وتأهيلها وتحويلها لمرحلة عصور ما قبل التاريخ وحتى العصر الحديث، كما يشمل متحفاً بورشة إصلاح القاطرات بالمحطة يعرض تاريخ سكة حديد الحجاز ، ويضم ضمن مبنى المحطة الرئيسة، قاعة المعارض الزائرة والمؤقتة، وقاعة المحاضرات والعرض المرئي .
وتشمل مكونات المرحلة الأولى من متحف المدينة المنورة (14) قاعة عرض تشمل بهو المتحف، وقاعات بيئة المدينة المنورة وتاريخها الطبيعي، والمدينة المنورة قبل الإسلام، والمدينة المنورة في العهد النبوي، وقاعة زوجات الرسول صلى الله عليه وسلم وأبناؤه ، وقاعتي الأنصار والمهاجرين، وقاعة المسجد النبوي الشريف، وقاعات المدينة المنورة في عهد الخلفاء الراشدين، وقاعة المدينة المنورة خلال العصور ألإسلامية والمدينة المنورة في عهد الدولة السعودية الأولى والمدينة المنورة في عهد الدولة السعودية الثانية، والمدينة المنورة في عهد الملك عبدالعزيز يرحمه الله، وقاعة التراث المديني.