تُعد الجمعية العمومية للاتحاد الآسيوي لكرة القدم أعلى هيئة في الاتحاد، تجتمع كل سنتين طبقا لمقتضيات النظام الأساسي. ويعقد الاتحاد اجتماعات طارئة بين الفينة والأخرى خلال كل سنة، كما وقع في السابق في الدوحة، قطر أكتوبر - تشرين الثاني 2003. ويجتمع كل أعضاء الجمعية العمومية في مكان واحد للتشاور حول مجموعة من القضايا أهمها تقديم اقتراحات لتعديل النظام الأساسي والنظر في انضمام أو طرد أو استقالة أحد الأعضاء وتقديم تقرير الأمين العام للسنتين السابقتين للاجتماع وتقديم الحسابات. ويشكل المؤتمر أيضاً فرصة لانتخاب أعضاء اللجنة التنفيذية.