شغل منصب نائب وزير العمل بتاريخ 21 شعبان 1432هـ، وتولى قبل ذلك وكالة وزارة العمل للتخطيط والتطوير، حيث بدأ حياته العملية أستاذا للاقتصاد والإحصاء بكلية الملك فهد الأمنية، وتدرج في عدة مناصب داخل كلية الملك فهد الأمنية، ثم
انتقل للعمل وكيلاً لإمارة منطقة جازان لمدة عامين اعتباراً من 5 ربيع الأول 1425هـ، وعضواً بمجلس منطقة جازان، ورئيس لجنة التخطيط والمتابعة بالمجلس، ومشرفاً على الكثير من رسائل الدكتوراه والماجستير.
وصدر قرار مجلس الوزراء بتاريخ 26 رجب 1427هـ بتعيينه أميناً عاماً للجنة الوطنية لمكافحة المخدرات، كما شغل الكثير من المناصب الإدارية والإشرافية.
وحصل الدكتور مفرج الحقباني على شهادتي الماجستير والدكتوراه في الاقتصاد من جامعة ولايـة كلورادو في الولايات المتحدة الأمريكية عام1991م.
وتخصص في التنمية الاقتصادية وفي النظرية النقدية الدولي.
ولمعاليه عدة أبحاث منشورة منها (تقدير أثر مجلس التعاون الخليجي: نموذج اقتصادي كلي)، و(نحو سياسات اقتصادية فاعلة لسعودة فرص العمل في القطاع الخاص)، وبحث في (المخدرات وأثرها على الاقتصاد القومي)، و(العلاقة السببية بين اتجاهات التجارة الخارجية والنمو الاقتصادي: دراسة تطبيقية على بعض دول مجلس التعاون الخليجي باستخدام التكامل المشترك)، و(الآثار الاقتصادية المحتملة لانتشار الشائعات).
كما قدم الدكتور الحقباني خلال السنوات الماضية عدة أبحاث علمية منها بحث بعنوان (العلاقة بين الإنفاق الحكومي والنمو الاقتصادي في المملكة العربية السعودية (باللغة الإنجليزية)، و(العلاقة بين الانفتاح الاقتصادي والنمو في المملكة العربية السعودية باستخدام التكامل المشترك (باللغة الإنجليزية).
وقدم كذلك خلال فترة عمله عدة كتب منها: (المبادئ الأساسية للإحصاء: تطبيقات في المجال الأمني (يُدرس لطلبة كلية الملك فهد الأمنية وضباط المعهد العالي للدراسات الأمنية) و(مبادئ علم الاقتصاد: بالاشتراك (يُدرس لطلبة كلية الملك فهد الأمنية)، و(التعاون الاقتصادي الخليجي بين النظرية والتطبيق).
كما حصل معاليه على العديد من الجوائز وشهادات التقدير.